US 9,422,350 B2Granted

Target of EGR1 (TOE1) polypeptides for inhibition of HIV

OwnerIan De Belle, Sabina Sperandioinventors

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Abstract

Described are methods and compositions for preventing and/or treating HIV infection, as well as in vitro and in vivo methods of inhibiting HIV replication, inhibiting HIV viral transcription, inhibiting the viral Tat protein, and inhibiting HIV LTR expression. The methods involve administering a Target of Egr1 (TOE1) polypeptide, fragment or deletion mutant thereof, either to a subject in need of treatment or to a cell infected with an HIV virus. Compositions may comprise the described polypeptide, or an encoding polynucleotide thereof.

Claims16

Dependent claims

A polypeptide conjugate comprising (1) an amino acid sequence consisting of an amino acid sequence that is between 80% and 100% identical to the sequence of SEQ ID NO:2;

SEQ ID NO:3;
SEQ ID NO:4;
SEQ ID NO:5;
SEQ ID NO:6;
SEQ ID NO:7;
SEQ ID NO:9;
SEQ ID NO:10;
SEQ ID NO:11;
SEQ ID NO:12;
SEQ ID NO:13;
SEQ ID NO:14;
SEQ ID NO:16 or SEQ ID NO:17, or that is 100% identical to the sequence of SEQ ID NO:8;
or which consists of an amino acid sequence that is between 80% and 100% identical to the sequence of a deletion mutant of Target Of Early Growth Response Gene 1 (TOE1), selected from the group consisting of G18/D363 (SEQ ID NO:104);
G18/D373 (SEQ ID NO:105);
G18/D387 (SEQ ID NO:106);
G18/D402 (SEQ ID NO:107);
G18/D416 (SEQ ID NO:108);
G8/D363 (SEQ ID NO:112);
G8/D373 (SEQ ID NO:113);
G8/D387 (SEQ ID NO:114);
G8/D402 (SEQ ID NO:115);
S5/D363 (SEQ ID NO:120);
S5/D373 (SEQ ID NO:121);
S5/D387 (SEQ ID NO:122);
and S5/D402 (SEQ ID NO:123);
or that is between 85% and 100% identical to the sequence of deletion mutant of TOE1 G18/D435 (SEQ ID NO:109);
G18/D443 (SEQ ID NO:110);
G8/D416 (SEQ ID NO:116);
G8/D435 (SEQ ID NO:117);
or S5/D416 (SEQ ID NO:124);
or that is between 90% and 100% identical to the sequence of deletion mutant of TOE1 G8/D443 (SEQ ID NO:118);
S5/D435 (SEQ ID NO:125);
or S5/D443 (SEQ ID NO:126);
or that is 100% identical to the sequence of deletion mutant of TOE1 G18/S510 (SEQ ID NO:111);
G8/S510 (SEQ ID NO:119);
or S5/S510 (SEQ ID NO:127), wherein the indicated amino acids respectively specify the amino- and carboxy-terminal residues of the deletion mutants based on the sequence of SEQ ID NO:1, and, (2) a linked heterologous carrier molecule.

33 more elements

A polypeptide conjugate comprising:

(1) an amino acid sequence that is any one of SEQ ID NO:2;
SEQ ID NO:3;
SEQ ID NO:4;
SEQ ID NO:5;
SEQ ID NO:6;
SEQ ID NO:7;
SEQ ID NO:8;
SEQ ID NO:9;
SEQ ID NO:10;
SEQ ID NO:11;
SEQ ID NO:12;
SEQ ID NO:13;
SEQ ID NO:14;
SEQ ID NO:16 or SEQ ID NO:17, or the amino acid sequence of a deletion mutant of TOE1 selected from the group consisting of K335/D373 (SEQ ID NO:21);
K335/D387 (SEQ ID NO:22);
K335/D402 (SEQ ID NO:23);
K335/D416 (SEQ ID NO:24);
K335/D435 (SEQ ID NO:25);
K335/D443 (SEQ ID NO:26);
K335/S510 (SEQ ID NO:27);
E329/D363 (SEQ ID NO:28);
E329/D373 (SEQ ID NO:29);
E329/D387 (SEQ ID NO:30);
E329/D402 (SEQ ID NO:31);
E329/D416 (SEQ ID NO:32);
E329/D435 (SEQ ID NO:33);
E329/D443 (SEQ ID NO:34);
E329/S510 (SEQ ID NO:35);
L323/D363 (SEQ ID NO:36);
L323/D373 (SEQ ID NO:37);
L323/D387 (SEQ ID NO:38);
L323/D402 (SEQ ID NO:39);
L323/D416 (SEQ ID NO:40);
L323/D435 (SEQ ID NO:41);
L323/D443 (SEQ ID NO:42);
L323/S510 (SEQ ID NO:43);
I321/D363 (SEQ ID NO:44);
I321/D373 (SEQ ID NO:45);
I321/D387 (SEQ ID NO:46);
I321/D402 (SEQ ID NO:47);
I321/D416 (SEQ ID NO:48);
I321/D435 (SEQ ID NO:49);
I321/D443 (SEQ ID NO:50);
I321/S510 (SEQ ID NO:51);
N302/D363 (SEQ ID NO:52);
N302/D373 (SEQ ID NO:53);
N302/D387 (SEQ ID NO:54);
N302/D402 (SEQ ID NO:55);
N302/D416 (SEQ ID NO:56);
N302/D435 (SEQ ID NO:57);
N302/D443 (SEQ ID NO:58);
N302/S510 (SEQ ID NO:59);
Y283/D435 (SEQ ID NO:60);
Y283/D443 (SEQ ID NO:61);
H280/D363 (SEQ ID NO:62);
H280/D373 (SEQ ID NO:63);
H280/D387 (SEQ ID NO:64);
H280/D402 (SEQ ID NO:65);
H280/D416 (SEQ ID NO:66);
H280/D435 (SEQ ID NO:67);
H280/D443 (SEQ ID NO:68);
H280/S510 (SEQ ID NO:69);
T229/D363 (SEQ ID NO:70);
T229/D373 (SEQ ID NO:71);
T229/D387 (SEQ ID NO:72);
T229/D402 (SEQ ID NO:73);
T229/D416 (SEQ ID NO:74);
T229/D435 (SEQ ID NO:75);
T229/D443 (SEQ ID NO:76);
T229/S510 (SEQ ID NO:77);
L218/D363 (SEQ ID NO:78);
L218/D373 (SEQ ID NO:79);
L218/D387 (SEQ ID NO:80);
L218/D402 (SEQ ID NO:81);
L218/D416 (SEQ ID NO:82);
L218/D435 (SEQ ID NO:83);
L218/D443 (SEQ ID NO:84);
L218/S510 (SEQ ID NO:85);
L196/D435 (SEQ ID NO:86);
L196/D443 (SEQ ID NO:87);
K111/D363 (SEQ ID NO:88);
K111/D373 (SEQ ID NO:89);
K111/D387 (SEQ ID NO:90);
K111/D402 (SEQ ID NO:91);
K111/D416 (SEQ ID NO:92);
K111/D435 (SEQ ID NO:93);
K111/D443 (SEQ ID NO:94);
K111/S510 (SEQ ID NO:95);
T65/D363 (SEQ ID NO:96);
T65/D373 (SEQ ID NO:97);
T65/D387 (SEQ ID NO:98);
T65/D402 (SEQ ID NO:99);
T65/D416 (SEQ ID NO:100);
T65/D435 (SEQ ID NO:101);
T65/D443 (SEQ ID NO:102);
T65/S510 (SEQ ID NO:103);
G18/D363 (SEQ ID NO:104);
G18/D373 (SEQ ID NO:105);
G18/D387 (SEQ ID NO:106);
G18/D402 (SEQ ID NO:107);
G18/D416 (SEQ ID NO:108);
G18/D435 (SEQ ID NO:109);
G18/D443 (SEQ ID NO:110);
G18/S510 (SEQ ID NO:111);
G8/D363 (SEQ ID NO:112);
G8/D373 (SEQ ID NO:113);
G8/D387 (SEQ ID NO:114);
G8/D402 (SEQ ID NO:115);
G8/D416 (SEQ ID NO:116);
G8/D435 (SEQ ID NO:117);
G8/D443 (SEQ ID NO:118);
G8/S510 (SEQ ID NO:119);
S5/D363 (SEQ ID NO:120);
S5/D373 (SEQ ID NO:121);
S5/D387 (SEQ ID NO:122);
S5/D402 (SEQ ID NO:123);
S5/D416 (SEQ ID NO:124);
S5/D435 (SEQ ID NO:125);
S5/D443 (SEQ ID NO:126);
S5/S510 (SEQ ID NO:127);
M1/D402 (SEQ ID NO:
128);
and M1/D373 (SEQ ID NO:129), wherein the indicated amino acids respectively specify the amino- and carboxy-terminal residues of the deletion mutants based on the sequence of SEQ ID NO:1;
and (2) a linked heterologous carrier molecule.

121 more elements

Dependencies are inferred from the claim text.

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