Synthases
AssigneesThe Salk Institute for Biological Studies, University of Kentucky Research Foundation
InventorsJoseph Chappell, Kathleen R. Manna, Joseph P. Noel, Courtney M. Starks
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Abstract
Novel synthases and the corresponding nucleic acids encoding such synthases are disclosed herein. Such synthases possess an active site pocket that includes key amino acid residues that are modified to generate desired terpenoid reaction intermediates and products. Synthase modifications are designed based on, e.g., the three-dimensional coordinates of tobacco 5-epi-aristolochene synthase, with or without a substrate bound in the active site.
Claims20
An isolated nucleic acid encoding a synthase, said synthase having a region with 40% or greater sequence identity to residues 265 to 535 of SEQ ID NO:2, wherein one or more amino acid residues of said synthase that align with amino acids at positions 270, 273, 294, 297, 298, 376, 401, 402, 403, 404, 407, 440, 444, 516, 519, 520, 525, 527, and 528 of SEQ ID NO:2 are residues other than the following ordered arrangements of residues:
- Ordered Arrangement of R-Groups at α-carbons 1-19 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 A C W I I S Y T T T Y B C W I I S Y T S T Y C G W I A S Y T C G Y D G W I A S Y T S G Y E C W L T S Y S A G Y F G W L L S Y S T V H G C W L T S Y S A G Y H L W I T T Y S V G N I P W I V D Y S T A G J A W V C G F T S C I K N F F L G A E I T A L C W N I T Y S I S G M S W V L T Y S S S Y N N F F L V N A T L A O C W N I T Y I S G P P C W N V T Y I G G I Q C Y L L T F A V T M R C W I I T Y S I S A S S W F I V F S S S V T S W I A T Y S V A S U N W N L T Y S I S S V F L A Q T Y S I G Q W I S S T V Y S I A L X Y L C I T Y S C G H Y G S F I T F S S S V Z Y W A C T Y S S G M AA A A N L T N A L T S BB F L C V T Y S S A Y CC F W A M T Y N T G M DD Y M C V T F V S S G EE V S G Q V Y S V G L FF C S G T T M F A L G GG C S G T T M S F A L HH C A G T T M S F A L II I W V I S Y T T G L JJ Y W A C T Y S S G M KK C W I I S Y T S T Y LL C W I I S Y T T T Y MM C W N I T Y S I S G NN F A A Q T Y S I G Q OO F A I A T Y S V A S 11 12 13 14 15 16 17 18 19 A L C D V T Y D Y T B L C D I T Y D Y T C L C D M L Y D Y T D L C D M L Y D Y T E I A N A L Y D Y T F L G D A V Y D Y T G I A N A L Y D Y S H L F D V L Y D F T I L S D A C Y D Y T J M G N C S Y D Y S K T G N I T Y E F T L M L D A M Y D H Q M L G G V L Y D F T N L G N L S Y E F T O L L D A M Y D H G P L L D A I Y D F G Q T G N I T Y D Y T R I L D A I Y D D G S I L N V I Y D H G T I L D A I Y D F G U I F N S M Y D H G V L S D T I F D F G W V G N M F Y D L T X S L G F G Y D Y S Y I L N A V Y D H G Z L G D L I Y D L Y AA T C M L L Y D T N BB V L G L L Y D F S CC L S D I M Y D F S DD I L G F V Y D Y T EE C W N V F Y D Y G FF V G N L F Y D F T GG I G N L F Y D F T HH I G N V F Y D Y T II V I N T S Y D Y T JJ L G D L I Y D L Y KK L C D V T Y D Y T LL L C D I T Y D Y T MM M L D A M Y D H G NN L S D T I F D F G OO I L D A I Y D F G.
Dependencies are inferred from the claim text.