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US 2003/0143539 A1Published application
Gene expression profiling of primary breast carcinomas using arrays of candidate genes
OwnerFrancois Bertucci, Remi Houlgatte +4inventors
InventorsFrancois Bertucci, Remi Houlgatte, Daniel Birnbaum, Catherine Nguyen, Patrice Viens, Vincent Fert
Life of this patent
Estimating the term…
Abstract
A polynucleotide library useful in the molecular characterization of a carcinoma, the library including a pool of polynucleotide sequences or subsequences thereof wherein the sequences or subsequences are overexpressed in tumor cells, further wherein the sequences or subsequences correspond substantially to any of the polynucleotide sequences set forth in any of SEQ ID NOS: 1-468 or the complement thereof.
Claims69
A polynucleotide library useful in the molecular characterization of a carcinoma, said library comprising a pool of polynucleotide sequences or subsequences thereof wherein said sequences or subsequences are either underexpressed or overexpressed in tumor cells, further wherein said sequences or subsequences correspond substantially to any of the polynucleotide sequences set forth in any of SEQ ID Nos:
- 1-468 or the complement thereof.
A polynucleotide library useful in the molecular characterization of a carcinoma, said library comprising a pool of polynucleotide sequences or subsequences thereof wherein said sequences or subsequences are overexpressed or underexpressed in tumor cells, further wherein said sequences or subsequences correspond substantially to any of the polynucleotide sequences set forth in any of SEQ ID No:
- 1, SEQ ID No:
- 3, SEQ ID No:
- 5, SEQ ID No:
- 7, SEQ ID No:
- 8, SEQ ID No:
- 9, SEQ ID No:
- 11, SEQ ID No:
- 13, SEQ ID No:
- 14, SEQ ID No:
- 16, SEQ ID No:
- 17, SEQ ID No:
- 18, SEQ ID No:
- 20, SEQ ID No:
- 22, SEQ ID No:
- 23, SEQ ID No:
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- 98, SEQ ID No:
- 102, SEQ ID No:
- 104, SEQ ID No:
- 109, SEQ ID No:
- 111, SEQ ID No:
- 112, SEQ ID No:
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- 160, SEQ ID No:
- 162, SEQ ID No:
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- 173, SEQ ID No:
- 174, SEQ ID No:
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- 178, SEQ ID No:
- 180, SEQ ID No:
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- 183, SEQ ID No:
- 185, SEQ ID No:
- 186, SEQ ID No:
- 187, SEQ ID No:
- 189, SEQ ID No:
- 190, SEQ ID No:
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- 196, SEQ ID No:
- 197, SEQ ID No:
- 201, SEQ ID No:
- 202, SEQ ID No:
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- 221, SEQ ID No:
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- 224, SEQ ID No:
- 226, SEQ ID No:
- 230, SEQ ID No:
- 231, SEQ ID No:
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- 238, SEQ ID No:
- 239, SEQ ID No:
- 240, SEQ ID No:
- 242, SEQ ID No:
- 243, SEQ ID No:
- 245, SEQ ID No:
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- 248, SEQ ID No:
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- 251, SEQ ID No:
- 253, SEQ ID No:
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- 259, SEQ ID No:
- 260, SEQ ID No:
- 263, SEQ ID No:
- 265, SEQ ID No:
- 269, SEQ ID No:
- 271, SEQ ID No:
- 277, SEQ ID No:
- 279, SEQ ID No:
- 280, SEQ ID No:
- 284, SEQ ID No:
- 286, SEQ ID No:
- 287, SEQ ID No:
- 289, SEQ ID No:
- 291, SEQ ID No:
- 293, SEQ ID No:
- 294, SEQ ID No:
- 296, SEQ ID No:
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- 299, SEQ ID No:
- 301, SEQ ID No:
- 302, SEQ ID No:
- 303, SEQ ID No:
- 305, SEQ ID No:
- 306, SEQ ID No:
- 308, SEQ ID No:
- 309, SEQ ID No:
- 311, SEQ ID No:
- 312, SEQ ID No:
- 314, SEQ ID No:
- 315, SEQ ID No:
- 317, SEQ ID No:
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- 320, SEQ ID No:
- 322, SEQ ID No:
- 323, SEQ ID No:
- 324, SEQ ID No:
- 326, SEQ ID No:
- 327, SEQ ID No:
- 329, SEQ ID No:
- 331, SEQ ID No:
- 332, SEQ ID No:
- 334, SEQ ID No:
- 335, SEQ ID No:
- 339, SEQ ID No:
- 340, SEQ ID No:
- 345, SEQ ID No:
- 347, SEQ ID No:
- 350, SEQ ID No:
- 352, SEQ ID No:
- 354, SEQ ID No:
- 356, SEQ ID No:
- 358, SEQ ID No:
- 359, SEQ ID No:
- 368, SEQ ID No:
- 369, SEQ ID No:
- 370, SEQ ID No:
- 374, SEQ ID No:
- 375, SEQ ID No:
- 380, SEQ ID No:
- 382, SEQ ID No:
- 383, SEQ ID No:
- 385, SEQ ID No:
- 386, SEQ ID No:
- 388, SEQ ID No:
- 392, SEQ ID No:
- 394, SEQ ID No:
- 402, SEQ ID No:
- 404, SEQ ID No:
- 405, SEQ ID No:
- 414, SEQ ID No:
- 415, SEQ ID No:
- 417, SEQ ID No:
- 418, SEQ ID No:
- 430, SEQ ID No:
- 431, SEQ ID No:
- 435, SEQ ID No:
- 437, SEQ ID No:
- 439, SEQ ID No:
- 440, SEQ ID No:
- 443, SEQ ID No:
- 444, SEQ ID No:
- 445, SEQ ID No:
- 446, SEQ ID No:
- 447, SEQ ID No:
- 448, SEQ ID No:
- 449, SEQ ID No:
- 450, SEQ ID No:
- 451, SEQ ID No:
- 452, SEQ ID No:
- 453, SEQ ID No:
- 454, SEQ ID No:
- 455, SEQ ID No:
- 456, SEQ ID No:
- 457, SEQ ID No:
- 458, SEQ ID No:
- 459, SEQ ID No:
- 460, SEQ ID No:
- 461, SEQ ID No:
- 462, SEQ ID No:
- 463, SEQ ID No:
- 464, SEQ ID No:
- 465, SEQ ID No:
- 466, SEQ ID No:
- 467, SEQ ID No:
- 468 or the complement thereof.
243 more elements
A library of polynucleotides comprising a population of polynucleotide sequences overexpressed or underexpressed in cells derived from a tumor selected from SEQ ID No:
- 1, SEQ ID No:
- 3, SEQ ID No:
- 5, SEQ ID No:
- 7, SEQ ID No:
- 8, SEQ ID No:
- 9, SEQ ID No:
- 11, SEQ ID No:
- 13, SEQ ID No:
- 14, SEQ ID No:
- 16, SEQ ID No:
- 17, SEQ ID No:
- 18, SEQ ID No:
- 20, SEQ ID No:
- 22, SEQ ID No:
- 23, SEQ ID No:
- 25, SEQ ID No:
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- 28, SEQ ID No:
- 30, SEQ ID No:
- 32, SEQ ID No:
- 33, SEQ ID No:
- 35, SEQ ID No:
- 36, SEQ ID No:
- 37, SEQ ID No:
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- 40, SEQ ID No:
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- 46, SEQ ID No:
- 48, SEQ ID No:
- 49, SEQ ID No:
- 51, SEQ ID No:
- 52, SEQ ID No:
- 54, SEQ ID No:
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- 59, SEQ ID No:
- 60, SEQ ID No:
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- 68, SEQ ID No:
- 69, SEQ ID No:
- 71, SEQ ID No:
- 73, SEQ ID No:
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- 89, SEQ ID No:
- 91, SEQ ID No:
- 94, SEQ ID No:
- 95, SEQ ID No:
- 97, SEQ ID No:
- 98, SEQ ID No:
- 102, SEQ ID No:
- 104, SEQ ID No:
- 109, SEQ ID No:
- 111, SEQ ID No:
- 112, SEQ ID No:
- 114, SEQ ID No:
- 115, SEQ ID No:
- 116, SEQ ID No:
- 120, SEQ ID No:
- 123, SEQ ID No:
- 126, SEQ ID No:
- 127, SEQ ID No:
- 129, SEQ ID No:
- 131, SEQ ID No:
- 133, SEQ ID No:
- 135, SEQ ID No:
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- 138, SEQ ID No:
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- 141, SEQ ID No:
- 142, SEQ ID No:
- 144, SEQ ID No:
- 145, SEQ ID No:
- 147, SEQ ID No:
- 148, SEQ ID No:
- 150, SEQ ID No:
- 153, SEQ ID No:
- 154, SEQ ID No:
- 156, SEQ ID No:
- 157, SEQ ID No:
- 159, SEQ ID No:
- 160, SEQ ID No:
- 162, SEQ ID No:
- 164, SEQ ID No:
- 166, SEQ ID No:
- 167, SEQ ID No:
- 168, SEQ ID No:
- 171, SEQ ID No:
- 173, SEQ ID No:
- 174, SEQ ID No:
- 176, SEQ ID No:
- 178, SEQ ID No:
- 180, SEQ ID No:
- 181, SEQ ID No:
- 183, SEQ ID No:
- 185, SEQ ID No:
- 186, SEQ ID No:
- 187, SEQ ID No:
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- 192, SEQ ID No:
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- 224, SEQ ID No:
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- 230, SEQ ID No:
- 231, SEQ ID No:
- 233, SEQ ID No:
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- 240, SEQ ID No:
- 242, SEQ ID No:
- 243, SEQ ID No:
- 245, SEQ ID No:
- 246, SEQ ID No:
- 248, SEQ ID No:
- 250, SEQ ID No:
- 251, SEQ ID No:
- 253, SEQ ID No:
- 255, SEQ ID No:
- 259, SEQ ID No:
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- 269, SEQ ID No:
- 271, SEQ ID No:
- 277, SEQ ID No:
- 279, SEQ ID No:
- 2 , SEQ ID No:
- 284, SEQ ID No:
- 286, SEQ ID No:
- 287, SEQ ID No:
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- 291, SEQ ID No:
- 293, SEQ ID No:
- 294, SEQ ID No:
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- 299, SEQ ID No:
- 301, SEQ ID No:
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- 324, SEQ ID No:
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- 334, SEQ ID No:
- 335, SEQ ID No:
- 339, SEQ ID No:
- 340, SEQ ID No:
- 345, SEQ ID No:
- 347, SEQ ID No:
- 350, SEQ ID No:
- 352, SEQ ID No:
- 354, SEQ ID No:
- 356, SEQ ID No:
- 358, SEQ ID No:
- 359, SEQ ID No:
- 368, SEQ ID No:
- 369, SEQ ID No:
- 3 , SEQ ID No:
- 374, SEQ ID No:
- 375, SEQ ID No:
- 380, SEQ ID No:
- 382, SEQ ID No:
- 383, SEQ ID No:
- 385, SEQ ID No:
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- 388, SEQ ID No:
- 392, SEQ ID No:
- 394, SEQ ID No:
- 402, SEQ ID No:
- 401, SEQ ID No:
- 430, SEQ ID No:
- 414, SEQ ID No:
- 415, SEQ ID No:
- 417, SEQ ID No:
- 418, SEQ ID No:
- 430, SEQ ID No:
- 431, SEQ ID No:
- 435, SEQ ID No:
- 437, SEQ ID No:
- 439, SEQ ID No:
- 440, SEQ ID No:
- 443, SEQ ID No:
- 444, SEQ ID No:
- 45 , SEQ ID No:
- 4 , SEQ ID No:
- 447, SEQ ID No:
- 448, SEQ ID No:
- 449, SEQ ID No:
- 450, SEQ ID No:
- 451, SEQ ID No:
- 452, SEQ ID No:
- 453, SEQ ID No:
- 454, SEQ ID No:
- 455, SEQ ID No:
- 456, SEQ ID No:
- 457, SEQ ID No:
- 45, SEQ ID No:
- 459, SEQ ID No:
- 460, SEQ ID No:
- 461, SEQ ID No:
- 462, SEQ ID No:
- 463, SEQ ID No:
- 464, SEQ ID No:
- 465, SEQ ID No:
- 466, SEQ ID No:
- 467, SEQ ID No:
- 468 and their respective complements.
243 more elements
A library of polynucleotide sequences for distinguishing a person with cancer from a person without cancer comprising SEQ ID No:
- 1, SEQ ID No:
- 7, SEQ ID No:
- 8, SEQ ID No:
- 39, SEQ ID No:
- 40, SEQ ID No:
- 46, SEQ ID No:
- 54, SEQ ID No:
- 55, SEQ ID No:
- 76, SEQ ID No:
- 91, SEQ ID No:
- 115, SEQ ID No:
- 116, SEQ ID No:
- 126, SEQ ID No:
- 127, SEQ ID No:
- 138, SEQ ID No:
- 139, SEQ ID No:
- 141, SEQ ID No:
- 142, SEQ ID No:
- 147, SEQ ID No:
- 148, SEQ ID No:
- 156, SEQ ID No:
- 157, SEQ ID No:
- 162, SEQ ID No:
- 168, SEQ ID No:
- 178, SEQ ID No:
- 204, SEQ ID No:
- 205, SEQ ID No:
- 216, SEQ ID No:
- 230, SEQ ID No:
- 231, SEQ ID No:
- 248, SEQ ID No:
- 250, SEQ ID No:
- 251, SEQ ID No:
- 265, SEQ ID No:
- 271, SEQ ID No:
- 308, SEQ ID No:
- 309, SEQ ID No:
- 311, SEQ ID No:
- 312, SEQ ID No:
- 317, SEQ ID No:
- 324, SEQ ID No:
- 345, SEQ ID No:
- 350, SEQ ID No:
- 368, SEQ ID No:
- 369, SEQ ID No:
- 417, SEQ ID No:
- 418, SEQ ID No:
- 430, SEQ ID No:
- 431, SEQ ID No:
- 437, SEQ ID No:
- 440, SEQ ID No:
- 450, SEQ ID No:
- 452, SEQ ID No:
- 453, SEQ ID No:
- 454, SEQ ID No:
- 460andSEQ ID No:
- 468.
54 more elements
A library of polynucleotide sequences for detecting hormone-sensitive tumors comprising SEQ ID No:
- 22, SEQ ID No:
- 23, SEQ ID No:
- 59, SEQ ID No:
- 60, SEQ ID No:
- 76, SEQ ID No:
- 82, SEQ ID No:
- 97, SEQ ID No:
- 98, SEQ ID No:
- 135, SEQ ID No:
- 136, SEQ ID No:
- 156, SEQ ID No:
- 157, SEQ ID No:
- 255, SEQ ID No:
- 279, SEQ ID No:
- 280, SEQ ID No:
- 322, SEQ ID No:
- 323, SEQ ID No:
- 331, SEQ ID No:
- 332, SEQ ID No:
- 334, SEQ ID No:
- 335, SEQ ID No:
- 345, SEQ ID No:
- 352, SEQ ID No:
- 354, SEQ ID No:
- 385, SEQ ID No:
- 386, SEQ ID No:
- 394, SEQ ID No:
- 402, SEQ ID No:
- 414, SEQ ID No:
- 415, SEQ ID No:
- 443 and SEQ ID No:
- 457.
29 more elements
A library of polynucleotide sequences for distinguishing a tumor in which a lymph node has been invaded by a tumor cell from a tumor in which a lymph node has not been invaded by a tumor cell comprising SEQ ID No:
- 16, SEQ ID No:
- 22, SEQ ID No:
- 23, SEQ ID No:
- 39, SEQ ID No:
- 40, SEQ ID No:
- 57, SEQ ID No:
- 76, SEQ ID No:
- 82, SEQ ID No:
- 97, SEQ ID No:
- 98, SEQ ID No:
- 135, SEQ ID No:
- 136, SEQ ID No:
- 216, SEQ ID No:
- 238, SEQ ID No:
- 239, SEQ ID No:
- 250, SEQ ID No:
- 251, SEQ ID No:
- 322, SEQ ID No:
- 323, SEQ ID No:
- 326, SEQ ID No:
- 327, SEQ ID No:
- 329, SEQ ID No:
- 334, SEQ ID No:
- 335, SEQ ID No:
- 374, SEQ ID No:
- 375, SEQ ID No:
- 402, SEQ ID No:
- 430, SEQ ID No:
- 439, SEQ ID No:
- 444, SEQ ID No:
- 445 and SEQ ID No:
- 457.
29 more elements
A library of polynucleotide sequences for distinguishing anthracycline-sensitive tumors from anthracyline-insensitive tumors comprising SEQ ID No:
- 22, SEQ ID No:
- 23, SEQ ID No:
- 48, SEQ ID No:
- 49, SEQ ID No:
- 51, SEQ ID No:
- 52, SEQ ID No:
- 59, SEQ ID No:
- 60, SEQ ID No:
- 65, SEQ ID No:
- 66, SEQ ID No:
- 73, SEQ ID No:
- 74, SEQ ID No:
- 76, SEQ ID No:
- 82, SEQ ID No:
- 86, SEQ ID No:
- 135, SEQ ID No:
- 136, SEQ ID No:
- 156, SEQ ID No:
- 157, SEQ ID No:
- 178, SEQ ID No:
- 194, SEQ ID No:
- 226, SEQ ID No:
- 308, SEQ ID No:
- 309, SEQ ID No:
- 326, SEQ ID No:
- 327, SEQ ID No:
- 331, SEQ ID No:
- 332, SEQ ID No:
- 354, SEQ ID No:
- 385, SEQ ID No:
- 386, SEQ ID No:
- 392, SEQ ID No:
- 394, SEQ ID No:
- 433, SEQ ID No-. 434, SEQ ID No:
- 444 and SEQ ID No:
- 456.
33 more elements
Dependencies are inferred from the claim text.